Em endocrinologia, o HC possui o Serviço de Endocrinologia e Metabologia (SEMPR), que completou 10 anos de atuação em 2009. É um centro de referência nacional na assistência médica, ensino, formação profissional e pesquisa em doenças endócrinas e metabólicas. Possui destaque internacional pela participação em inúmeros estudos multicêntricos visando a descoberta de novos tratamento para diabetes, obesidade, osteoporose, câncer de tireóide e tumores de hipófise, entre outros tantos problemas glandulares.

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